Ces projets ⁽¹⁾ étudient le repliement d'un type de protéines possédant un "domaine WW" réellement très fréquent dans beaucoup de variétés de protéines. Nous faisons ces simulations sur les protéines humaines et celles de la souris.


Client : Classique
Nombre d'atomes : 8810
Preferred deadline : 42
Final deadline : 61
Points : 218

⁽¹⁾ Projets 3044 à 3049



^{Les domaines - leur fonction - leur spécificité}



Note de Cobra : Il existe une multitude de types de protéines et certaines n'ont pas d'activité enzymatique propre mais sont très importantes dans la transduction du signal protéine-protéine. Ce genre de structure est appelée parfois "modules de liaison" qui sont classés en noms de domaine dont les plus fréquents sont SH2, PTB, PH, SH3 et WW. Le "domaine WW" comporte environ 40 résidus (acides aminés) qui se fixent sur des séquences riches en proline, dans ses protéines cibles, et cela grâce à la présence d'un feuillet bêta riche en acides aminés hydrophobes qui favorisent l'interaction avec ces régions. Il est surtout à retenir que ces "voies de signalisation" doivent fonctionner correctement car si le signal est altéré ou la réception mauvaise, l'interaction ne se produit pas dans les conditions normales et la cellule elle-même subit des altérations. La prolifération incontrôlée de ces cellules "malades" peut enclencher un processus catastrophique pour l'organisme tout entier amenant au cancer, groupe de maladies caractérisées par des anomalies de la transduction du signal, aux désordres cardiovasculaires ou immunitaires.


Définitions - Explications

- Domaines structuraux et signalisation
- Spécificités et fonctions des domaines


Stanford - Texte original

In these projects, we're studying the folding of a kind of protein called a 'WW domain' that is actually a very common fold in a lot of kinds of proteins. We're doing simulations of proteins from human and from mouse.