Les projets 3036, 3037 et 3042 ont fourni une énorme quantité de données concernant cette protéine "Villin headpiece" dont le repliement est très rapide. Ces trois projets⁽¹⁾ sont de nouveaux tests ayant pour but de valider les prédictions obtenues avec le projet 3036.


Client : SMP
Nombre d'atomes : 9679
Preferred deadline : 36 heures
Final deadline : 72 heures
Points : 1440

⁽¹⁾ Projets 3050, 3051 et 3052





Note de Cobra : Les projets 3000 à 3043 terminés concernaient les simulations sur des protéines qui ont été retenues pour leur caractéristique principale à se replier très rapidement (sur une échelle de temps de la microseconde). La simulation ayant trait à la protéine "Villin headpiece" se faisait dans différentes conditions de solvants. Il s'agit d'une toute petite protéine de 36 résidus à structure en hélice alpha qui a déjà été beaucoup étudiée. Elle se plie tellement vite qu'une simulation habituelle de dix microsecondes ne permet pas de "voir". Des centaines de microsecondes sont nécessaires.


Stanford - Texte original

Projects 3036, 3037 and 3042 have produced an immense amount of data about this very fast-folding protein, the villin headpiece. These three projects are new tests designed to validate the predictions we have made with folding in project 3036.

Points and deadlines:
projects 3050-3052: 1440 points, deadline 72 hours