Dimanche 6 décembre 2009 - 20h50 (23h50)

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Valà, c'est terminé :

- p5900 à 5904
- p5912 à 5915
- p6316



Et j'ai remarqué que les responsables de projets ne se foulent plus pour remplir leur descriptif, voyez les derniers projets, y a rien, je ne peux pas faire mon travail

Et maintenant...


Dimanche 6 décembre 2009 - 8h30 (11h30)

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Depuis trèèèèèès tôt, ce matin, je bosse duuuuurrrrr pour folding

Ce soir, je devrais avoir bouclé les dernières fiches de projets en cours. Sur les 3 séries différentes qui restent, je viens de terminer la première (publication cet aprèm), Les deux autres séries ont déjà été traitées par toTOW. Si ça convient à ma présentation, je pompe direct sinon, j'adapte ou je corrige


Samedi 5 décembre 2009 - 20h10 (23h10)

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Une série de projets 5787 à 5798 où l'on apprend que la protéine drkN est naturellement en équilibre instable, balançant entre l'état plié et déplié, mais que la substitution de son mutant T22G, sous certaines conditions, la rend parfaitement stable à l'état replié.

Les simulations portent respectivement sur la drkN et le mutant T22G et la "full production" laisse entrevoir une publication.

Ça avance, ça avance... bientôt je n'aurai plus de fiches à remplir, j'aurai ainsi fait tous mes devoirs


Samedi 5 décembre 2009 - 8h45 (11h45)

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Pour les deux dernières séries de projets, j'ai omis une remarque trèèèèès importante, que je viens d'apporter dans ma note perso. Stanford précise dans la description qu'il s'agit de projets "en pleine production" (c'est du moins comme ça que je traduis), ce qui signifie qu'il ne s'agit pas de simples tests mais d'études nouvelles bien ciblées qui doivent donner lieu à une publication.

En fait, les simulations FAH ont lieu à plusieurs niveaux, depuis les tests de base jusqu'à la "full production" pour obtenir des résultats à publier. Il faudrait que je retrouve ces différents niveaux et leurs appellations précises.


Vendredi 4 décembre 2009 - 20h30 (23h30)

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Nouvelles fiches de projets en cours publiées : p5765 à p5772. Tout le monde a déjà décortiqué cette protéine NTL9, abréviation de "N-terminal domain of ribosomal protein L9". Folding@home espère en retirer quelque chose de plus, avec des paramètres différents dont les températures qui sont fondamentales dans le jeu des réactions entre les atomes.

Puisqu'on parle de "températures", on a tous remarqué que celle-ci est notée dans le nom générique de la WU. Par exemple la première fiche de notre présente série est "p5765_NTL9_300K" et la dernière "p5772_NTL9_450K". "300K" et "450K" sont les températures en question et elles ne sont exprimées ni en degré Celsius ni en degré Fahrenheit, mais en kelvin (symbole K du nom de Lord Kelvin). Sachant que 0 K = -273,15° Celsius, nous obtenons, par une simple soustraction, 300 K = 26,85° Celsius et 450 K = 176,85° Celsius.

Pour plus d'informations sur le kelvin, notre ami Wikipédia est là
Mais bon, tout le monde sachant tout ça, disons que je me parlais à moi-même


Vendredi 4 décembre 2009 - 5h55 (8h55)

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Je me pose parfois la question de savoir si le sens de la citation qui défile est bien compris dans toute sa saveur. Il est vrai que si on ne connaît pas le texte original, ça peut sembler tiré par les cheveux. Pourtant il y a souvent trois niveaux de lecture : la citation en elle-même, sans en connaître l'origine, puis, la connaissance de l'original apporte un petit quelque chose en plus, et le troisième niveau, lorsqu'il est présent, contient un sens caché.

Explications sur la citation du jour : "Mini wu, mini point mais elle fait chaque jour le maximum (pub MIR / Chtiminette)".

D'abord, il y a lieu de remarquer que les mots qui sont changés sont en italique.

Le premier niveau de lecture ne pose ici aucune difficulté, tout le monde peut en comprendre le sens, mais lorsque l'on connaît l'origine de la citation (deuxième niveau), c'est mieux :


Et ce deuxième niveau de lecture apporte une petite saveur supplémentaire, quand on voit que la Chtie a remplacé "il" par "elle"

Le troisième niveau est caché, il colle en général à l'actualité folding. Et l'actu, en ce moment (mon titi journal d'hier et la news de FAH-Addict), c'est le système de bonus généralisé à venir (plus vite on rend la wu et plus on a de points). Ce système profitera probablement surtout et essentiellement (reste à confirmer) aux grosses bécanes. D'où le petit clin d'oeil sympa à tous ceux qui ont des petites machines ("Mini wu, mini point...") et la motivation déterminée à quand même "faire chaque jour le maximum".

Capish ? Je suis certain maintenant que vous porterez sur les citations folding un nouveau regard


Jeudi 3 décembre 2009 - 20h25 (23h25)

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Aujourd'hui, j'ai pondu 4 fiches de projets en cours, de la série 576x, exclusivement sur la protéine L, mais cette fois-ci, les simus démarrent à partir de l'état plié et déplié.

Bientôt, la fin


Jeudi 3 décembre 2009 6h50 (9h50)

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Comme je le supposais hier, concernant l'annonce de Vijay sur le SMP2, FAH-Addict a rédigé une news aussi excellente que d'habitude. C'est bien le SMP2 pour MacOSX/Linux qui devrait sortir le premier, et cela avec le nouveau système de points à bonus (plus vite on rend le boulot et plus on a de points). Y en a qui aimeront, d'autres qui n'aimeront pas. Je sais déjà ce que j'en pense mais, bon, ça n'engagerait que moi et ce serait entrer dans une polémique inutile et non productive.

Sinon, ce matin, hop hop hop, j'ai dû vite corriger une longue phrase dans les projets publiés hier. Elle était un peu beaucoup bancale Je devrais laisser passer une nuit avant de faire une publication, car à tête reposée le lendemain, les idées sont plus claires.

Comme je suis en forme, en ce moment, ce soir, une nouvelle série sera publiée.


Mercredi 2 décembre 2009 - 19h05 (22h05)

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Les fiches pour les projets 5732 à 5747 ont été publiées. Et pour une fois, dans nos simulations, on ne replie pas les protéines mais on part de l'état natif (replié) et on les déplie. Je n'ai pas encore trouvé la plus petite illustration plus ou moins compréhensible. L'image restera donc en attente.

De mémoire, j'ai dit quelque part que mon objectif était de terminer ces fiches pour la mi-décembre. C'est en bonne voie, il n'en reste plus beaucoup à traiter


Mercredi 2 décembre 2009 - 5h15 (8h15)

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Sur son Blog, Vijay annonce de gros progrès dans les tests des cores du nouveau SMP2 (on peut en déduire que la sortie est imminente) et que l'attribution des points se fera sur une base de bonus comme pour les bigadv (c'est donc officiel). Mais FAH-Addict vous en a déjà parlé et vous en parlera encore mieux que moi.

Vous vous souvenez certainement de cette fameuse panne de serveurs des 11 et 12 novembre qui ont mis nos stats dans les choux Le re-crédit a officiellement commencé depuis le 23 novembre, avec annonce sur le blog de Vijay. C'est bien ce genre de communication, c'est ce qu'on souhaite, de la transparence dans l'information. Malheureusement, on peut déplorer un sacré manque de sincérité, et je pèse mes mots... me retenant pour ne pas utiliser un autre encore plus dur.

Ce matin, en faisant les "Indicateurs Statistiques FAH", et naviguant un peu sur les sites de stats, je tombe à nouveau sur le graphe d'EOC. Faites par vous-mêmes le calcul des pertes cumulées des 11 et 12 novembre et vérifiez avec le seul re-crédit du 23 !!! Il y a une perte sèche de plusieurs centaines de milliers de points. Regardez également vos comptes individuels, le compte n'y est absolument pas, pour la plupart.

Jusqu'à présent, je me disais, et crois même l'avoir dit ici d'ailleurs, que le re-crédit n'était pas terminé, qu'il faut être patient.
Mais je suis quand même allé jeter un oeil sur le forum officiel et là, je tombe à la renverse 12 pages de chamailleries, de disputes, de mots d'oiseaux face à des explications peu claires, confuses, pour cacher la vérité que Vijay a fini par se résoudre à lâcher : une faille dans le serveur des stats a entraîné la perte des liens entre les wu rendues et les donateurs. Dans l'impossibilité de retrouver les donateurs, le Pande Group a re-crédité selon des "approximations". Et le re-crédit est terminé depuis longtemps. Dans l'histoire, parait-il, certains auraient gagné et d'autres perdu... En regardant les stats de l'AF, on aura compris que nous, les francophones, on aura été les dindons de leurs approximations.

Pour conclure, les résultats de nos calculs n'ont pas été perdus, c'est l'essentiel, et les stats, on s'en moque un peu. Mais, encore une fois, c'est cette communication qui fait défaut, pourquoi attendre 12 pages, des centaines de posts, constater les frustrations et même les écoeurements et les abandons annoncés, pour enfin arrêter de mentir par omission et se résoudre enfin à dire la vérité ?


Mardi 1^er novembre 2009 - 20h20 (23h20)

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Quatre projets qui étudient le même sujet : les commutateurs protéiques. Mais deux d'entre eux sont traités par le client SMP et les deux autres par le client classique. Pour écrire ma note perso, afin de trouver un sens à la description succinte de Stanford, j'ai dû compulser pas mal de texte et j'ai trouvé ce sujet vraiment très intéressant. Comme quoi, on en a encore à apprendre de la nature.

Sinon, concernant la couleur "violette" des pages autres que celle de l'Accueil, je crois que c'est davantage l'association de la couleur elle-même et le noir du texte pas très lisible que donnaient cette impression de "flashouillage". J'ai essayé avec des lettres blanches, et cet effet disparaît. Et je dirai même que j'aime bien et ça s'harmonise avec les teintes que l'on retrouve dans la bannière.

Faites encore Ctrl+F5 et dites-moi ce que vous en pensez...

Mais bon, pour l'instant, fermez les yeux sur le dégradé noir des rubriques, il me reste à trouver une soluce car je peux le modifier (couleur, épaisseur) mais probablement pas le virer complètement.


Mardi 1^er novembre 2009 - 15h00 (18h00)

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Il y a eu une petite maintenance des serveurs aujoud'hui et j'ai dû débloquer les commentaires avec retard. Vous avez donc pu voir pendant suffisamment longtemps le 9933ff pour que vos tits zieux soent un peu brûlés

Faites Ctrl+F5 si vous voulez voir le 9966cc mais c'est à vos risques et périls


Lundi 30 novembre 2009 - 20h00 (23h00)

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Dans son dernier commentaire, la Chtie a voulu m'envoyer chez l'ophtalmo Elle veut absoluuuuuument que je teste en réel au moins la couleur la plus pâle qu'elle a donnée en dernier lieu (9933ff). Hum... chuis pas convaincu, je sens que mes zieux commencent à brûler Dites ce que vous en pensez dans un commentaire...

Pour voir, faites d'abord Ctrl+F5 !

Sinon, hier, entre deux modifs du blog, je me suis détendu à mettre les bandes-annonces pour le film 2012.

Over Blog a annoncé une petite maintenance pour demain matin, pouvu qu'il ne casse pas tout comme la dernière fois...


Lundi 30 novembre 2009 - 6h55 (9h55)

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Moi, j'aime bien les stats, quand il s'agit de mesurer l'audience du projet en général et la puissance réelle développée en TFLOPS de tous nos ordis réunis. On voit ainsi si le projet progresse, si davantage de gens sont sensibilisés. C'est en fait le seul objectif recherché par la tenue des "Indicateurs Statistiques FAH" qui donnent une photographie de l'audience active du projet à l'instant t.

[Mode hypocrite on]
Sinon, Ô grand jamais, je ne regarde les stats individuelles, et surout pas les miennes c'est en faisant les Indicateurs que je suis obligé de tomber dessus

Et qu'est-ce que je vois, ce matin ?


C'est devenu trop rare, ces derniers temps, de voir la coupe d'or pour le serpent, que je ne pouvais pas rater l'occasion de faire cette capture

[Mode hypocrite off]

Bon, maintenant que les 3 colonnes sont en place, à part quelques petits trucs à encore régler, il faut que je recommence à travailler sur les fiches de projets en cours que j'adooooore