Les projets 3459-3464 sont des projets pour le client Folding@home de la PS3. Ils s'apparentent à ceux de la série 3451-3458, mais nous testons maintenant quelques champs de force de dernière génération, en plus des paramètres diélectriques internes, dans le modèle de solvatation.


Client : PS3
Nombre d'atomes : 264
Preferred deadline : 3 jours
Final deadline : 6 jours
Points : 251





Note de Cobra : voir la note sur la série 3445-3450

GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations) est un logiciel de simulation de dynamique moléculaire. Développé à l'origine par l'Université de Groningen (d'où son appellation), il est actuellement maintenu et étendu en divers établissements, surtout des universités. Réputé pour sa rapidité, il forme l'ossature principale des cores pour le calcul du repliement des protéines dans notre projet Folding@home.

Puisqu'on parle ici du client PS3, précisons que chaque mise à jour a apporté une petite nouveauté visuelle ou ergonomique mais a concerné parfois la possibilité de traiter des cores davantage optimisés. Par exemple, le passage à la version 1.3 a permis l'ajout du modèle de solvant implicite de Generalized Born. Par ailleurs, Stanford incorpore des paramètres issus de ses propres recherches internes et chaque projet d'une série inclut des valeurs différentes.


Stanford - Texte original

"Projects 3459-3464 are projects for the PlayStation3 Folding@Home client. These are akin to projects 3451-3458, but we're now testing some new latest-generation forcefields in addition to the inner dielectic parameters in the solvation model."