Folding City


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 3  piéton(s) dans la villeFolding est la poésie des cores (Honoré de Balzac / Juliette)

Pendant que ça plie...

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Le dogme central de la biologie moléculaire est que l'ADN est transcrit en ARN, qui est ensuite traduit en protéines. L'ADN et les protéines ont suscité beaucoup d'attention en raison de leurs rôles respectifs, comme l'encodage de la vie, et les machines moléculaires qui font fonctionner la vie. L'ARN, cependant, a été considéré davantage comme messager moléculaire qui transmet tout simplement des informations entre ses homologues désignés. Des travaux récents, toutefois, ont démontré que les molécules d'ARN jouent également des rôles fonctionnels importants semblables aux protéines. Ainsi, nous avons bien saisi l'intérêt de la compréhension de leur repliement. L'objectif de ces projets est d'acquérir une compréhension systématique du repliement des ARN, en commençant par de petits motifs en épingle à cheveux. Une épingle à cheveux est juste un brin d'ARN replié sur lui-même, mais il joue des rôles étonnamment intéressants dans les systèmes biologiques. Pour comprendre ces épingles à cheveux, nous avons mis en œuvre un nouvel algorithme d'échantillonnage. Les projets 4400-4432 constituaient la première phase de ce nouvel algorithme. Les projets 4433-4499 représentent la nouvelle phase.


Client : Classique
Nombre d'atomes : 7885
Preferred deadline : 43 jours
Final deadline : 63 jours
Points : 225





Note de Cobra : Le noyau de la cellule contient l'information génétique inscrite dans la molécule d'ADN. Cette information génétique est constituée de gènes qui sont des fragments d'ADN. Pour pouvoir sortir du noyau, l'information génétique doit être copiée et cette copie donne l'ARN. Le mécanisme de cette synthèse ADN-ARN est appelé "transcription". Cet ARN, connu sous l'appelation "ARN messager" ou "ARNm", va pouvoir sortir du noyau, pour aller dans le cytoplasme, où il sera traduit en une protéine. Ce deuxième mécanisme est appelé "traduction". Mais les molécules d'ARN ne se résument pas seulement à l'ARN messager. Elles sont nombreuses (ARNr, ARNm, ARNt, etc) et exercent autant de fonctions complexes dans la cellule. Et c'est ce que proposent d'étudier les présents projets 4433-4499.


Définitions et explications

- ADN
- ARN


Stanford - Texte original

"The central dogma of molecular biology is that DNA is transcribed into RNA, which is then translated into proteins. DNA and proteins have received a great deal of attention due to their respective roles as the encoding of life and the molecular machines that make life work. RNA, however, has been viewed as more of a molecular post-it note that simply passes information between its more interesting counterparts. Recent work, however, has demonstrated that RMA molecules also play important functional roles similar to proteins. Thus, we have taken an interest in understanding their folding as well. The objective of these projects is to gain a systematic understanding of RNA folding starting with small hairpin motiffs. A hairpin is just a single strand of RNA folded back on itself but plays some surprisingly interesting roles in biological systems. To understand these hairpins we have implemented a new sampling algorithm. Projects 4400-4432 constituted the first phase of this new sampling algorithm. Projects 4433-4499 are the next phase."





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